在离婚案件中，有两个男孩的抚养权判决通常遵循以下原则：
协议优先
夫妻双方可以通过协商决定孩子的抚养权归属。如果双方能够达成协议，法院通常会尊重双方的意愿，并在离婚协议书中明确写明孩子随哪一方生活。
年龄因素
两周岁以下的子女：一般随母亲生活，但若母亲存在特殊情况（如患有严重疾病、无法履行抚养义务等），孩子可以随父亲生活。
两周岁到十周岁之间的子女：法院会综合考虑双方的经济能力、抚养条件、孩子的意愿等因素，按照有利于子女成长的原则进行判决。
十周岁以上的子女：法院会尊重孩子的真实意愿，并在法律允许的前提下尽可能地满足他们的需求。
法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或母直接抚养，仍是父母双方的子女。法院在审理离婚案件时，会从有利于子女身心健康、保障子女合法权益的角度出发，结合父母双方的抚养能力和抚养条件等具体情况妥善解决。
特殊情况
如果一方坚决反对离婚或双方在离婚问题上存在严重分歧，法院将进行深入的调解工作或正式审判，根据具体案情做出公正的判决。
建议
协商一致：如果夫妻双方能够就孩子的抚养权达成一致意见，这是最为理想的情况，可以避免长时间的诉讼和孩子的分离。
准备证据：如果无法协商一致，建议双方提前准备好相关证据，包括经济状况、抚养能力、孩子的意愿等，以便在法庭上有充分的证据支持自己的主张。
寻求专业帮助：在离婚过程中，建议寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到最大程度的保障。
通过以上原则和程序，法院会尽力做出一个既符合法律规定又能保障孩子利益的判决。