处理车辆违章扣分，车主需要按照以下步骤进行：
准备材料：
携带个人驾驶证和车辆行驶证前往当地交警大队。
前往违章处理窗口：
在交警大队的违章处理窗口，提交相关材料以进行违章业务处理。
查询违章记录：
请求工作人员查询驾驶证分数和车辆的具体违章记录，包括违章次数、扣除的分数以及罚款金额。
确认并处理违章：
确认所有违章记录无误后，车主将获得一份交通违章缴款单，需签字确认并在签字栏下方注明“无异议”。
缴纳罚款：
根据缴款单上的金额，车主需在指定银行完成罚款的缴纳。注意必须在收到罚款的行政处罚决定书之日起十五日内缴纳罚款，否则将面临滞纳金。
保留单据：
车主保留两份单据，一份作为存根，另一份用于银行缴款。
处理异议：
如果机动车驾驶人对道路交通安全违法行为的处罚决定有异议，可以选择申请行政复议或提起行政诉讼。一旦这些法律程序导致原处罚决定被变更或撤销，相应的记分分值也会相应调整。
学习考试：
对于扣满12分的情况，车主需要重新参加考试。对于C照以上的驾照，扣分过多可能还需参加驾照规则培训。
通过以上步骤，车主可以顺利完成车辆违章扣分的处理。建议车主在处理过程中仔细核对违章记录，确保处理的准确性，并在规定时间内完成罚款缴纳，以避免不必要的麻烦和滞纳金。