公司发放工资的方法主要有以下几种：
企业直接发放
公司可以直接将工资发放给员工，这种方式较为常见，尤其是规模较小或员工较少的公司。
银行代发
公司可以与银行签订代发协议，通过银行将工资批量转入员工的工资卡。这种方式更为规范，尤其适用于员工较多、工资发放较为复杂的大型企业。
工资发放的具体流程：
签订代发协议
公司需要与选定的银行签订代发工资的协议，明确双方的权利和义务。
提供员工信息
公司需要向银行提供员工的银行卡号、开户行等信息，以便银行进行代发操作。
工资发放计算
公司财务部门会根据员工的考勤记录、绩效考核等因素，计算每个员工的工资，包括基本工资、绩效工资、加班费、扣除项（如社保、公积金）及其他补贴或扣款。
工资发放日期
工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付，通常为每月的固定日期。如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。
工资条发放
在发放工资的同时，公司会向员工提供工资条，员工可以根据工资条核对工资明细，如有异议可以及时提出。
记录和保存
用人单位必须书面记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者的姓名及签字，并保存两年以上备查。同时，用人单位还需向劳动者提供一份其个人的工资清单。
法律依据：
根据《工资支付暂行规定》第六条，用人单位应将工资支付给劳动者本人。劳动者本人因故不能领取工资时，可由其亲属或委托他人代领。用人单位可委托银行代发工资。
建议：
选择银行代发工资的方式，可以大大提高工资发放的效率和准确性，减少现金管理的风险和不便。
公司应确保工资发放的及时性和透明度，维护员工的合法权益。同时，建立完善的工资记录和保存制度，以备将来查询和审计。