发票被作废后，您应该按照以下步骤进行处理：
确认发票类型
如果是增值税专用发票，需要根据税务机关的规定，在税控机上作废或作红字冲销。
如果是增值税普通发票，通常需要收回所有联次并在发票上注明作废字样，然后到税务机关核销。
收回并处理
及时收回所有作废的发票联次，并在发票上加盖“作废”字样。
对于已经由购方认证过的增值税专用发票，需要与购货方沟通，如果还未认证，可以退回重新开具；如果已经认证，则需要购货方提供相应的证明，销售方再重新开具发票。
登记入账
在开票登记表或发票制证簿中填写“作废”字样，不需重新登记发票号码。
保存证据
发票开具方和使用方应保存并妥善存放作废发票的原件和复印件，以备查验。
发票管理系统
在发票管理系统中标明作废字样，以便日后查询。
归档备查
将作废的发票归档存储，以备后续查询使用。
遵守法规
根据《中华人民共和国发票管理办法实施细则》，已开具的发票存根联和发票登记簿及相关账册等应当保存5年，保存期满后，报经税务机关查验后销毁。
请确保遵循以上步骤，并与当地税务机关保持沟通，了解具体的作废流程和要求。