进项税额的计算方法如下：
增值税专用发票上的税额
从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额可以直接抵扣。
海关完税凭证上的税额
从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额也可以抵扣。
农产品扣税额
购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和一定扣除率（如13%或11%）计算的进项税额。
运输费用扣税额
购进或者销售货物以及在生产经营过程中支付运输费用的，按照运输费用结算单据上注明的运输费用金额和一定扣除率（如7%或11%）计算的进项税额。
其他扣税额
对增值税一般纳税人外购货物（固定资产除外）所支付的运输费用，根据运费结算单据（普通发票）所列运费金额，依一定扣除率（如10%）计算进项税额准予扣除，但随同运费支付的装卸费、保险费等其他杂费不得计算扣除进项税额。
从事废旧物资经营的增值税一般纳税人收购的废旧物资不能取得增值税专用发票的，根据经主管税务机关批准使用的收购凭证上注明的收购金额，依一定扣除率（如10%）计算进项税额予以扣除。
示例计算
假设企业购进了一批农产品，买价为10000元，增值税税率为10%，同时支付了运输费用2000元，运输费用的增值税扣除率为7%。
进项税额计算
农产品进项税额 = 10000元 × 10% = 1000元
运输费用进项税额 = 2000元 × 7% = 140元
总进项税额 = 1000元 + 140元 = 1140元
销项税额计算 （假设销售额为20000元，增值税税率为13%）：
销项税额 = 20000元 × 13% = 2600元
应纳增值税额计算
应纳增值税额 = 销项税额 - 进项税额 = 2600元 - 1140元 = 1460元
通过以上步骤和公式，企业可以准确计算进项税额，从而合理抵扣税款，降低应纳税额。