处理高速违章扣分的方法如下：
现场处理
如果违章是由交警现场执法处理的，只能在车辆违章地的交警队窗口处理。需要携带的材料包括行车证、驾驶证和身份证，接受处理并开具处罚单，然后再去银行缴纳罚款。
非现场处理
对于电子监控抓拍的违章，可以在车辆违章地交警队（高速交警）窗口处理，也可以在车辆注册地交警队窗口处理。同样需要携带行车证、驾驶证和身份证，接受处理并开具处罚单，然后再去银行缴纳罚款。
异地处理
如果违章发生在异地，可以选择以下几种方式处理：
本人亲自到当地交通管理部门接受处罚，需要携带驾驶证和行驶证或复印件。
通过异地朋友代办，将违章通知单、驾驶证、行驶证、身份证等证件的原件或复印件邮寄给朋友，请朋友代劳办理。但需要注意的是，某些省市交管部门不接受他人代办，仍需驾驶员本人办理。
扣分超过12分的情况
如果在一个记分周期内记分达到12分，公安机关交通管理部门会扣留其机动车驾驶证，机动车驾驶人需要按照规定参加道路交通安全法律、法规的学习并接受考试。考试合格后，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试。
缴纳罚款
无论哪种处理方式，都需要在接到处罚决定书之日起十五日内，前往指定的金融机构支付罚款。逾期未缴将产生滞纳金，每日按罚款金额的3%计算。
建议：
尽量选择亲自办理或通过信任的朋友代办，以确保流程顺利进行并避免不必要的麻烦。
及时缴纳罚款，以免产生额外的滞纳金。
如果对违章处罚有异议，可以通过法律途径提出申诉。