农村合作医疗卡的补办流程如下：
预挂失
医疗保险卡丢失后，可选择补卡或换卡。
预挂失有效期为10天，超过后自动解挂，社保卡恢复正常使用。
若急于看病就医，可到本市任意的社保卡服务网点办理撤销挂失手续。
正式挂失
正式挂失手续应由本人办理，特殊情况下如行动不便、高龄等可委托他人代办。
挂失人应出示本人身份证，委托他人代办的，须同时提供被委托人的身份证原件与复印件。
办理补卡
在正式挂失的同时应办理补卡手续，当场填写申请单，交给社保卡服务网点工作人员办理后开具领卡证明。
该证明可作为补卡人补卡期间的临时就医凭证。
15个工作日后，补卡人持本人的身份证和领卡证明到社保卡服务网点领取新卡。
补办费用
补办流程通常包括向当地农村合作医疗机构报失，填写相关申请表，提供相关证明材料如身份证、户口簿等，并缴纳一定的补办费用。
其他注意事项
在新农合服务网点，填写申请单，工作人员会开具一张领卡证明，在十五个工作日后可携带此证明到新农合服务网点领取新卡。
如果需要补交农村合作医疗费用，可以前往当地社保局或合作医疗管理部门了解补交流程和要求，并按照指引完成补交手续。有些地区可能提供网上补交或银行代缴的服务。
建议：
尽快办理挂失手续，以免影响就医。
准备好所有必要的证明材料，确保补办过程顺利。
如果选择网上补交或银行代缴，提前了解相关操作方法，确保补交过程顺畅。