建设银行扣款的方式主要有以下几种：
直接扣款
建设银行可以直接从用户的信用卡或借记卡账户中扣除相应的年费金额。具体扣款时间一般是在年费产生后的下一周期内，也可能是在用户的账单周期内。
自动续费
建行提供自动续费功能，在用户的信用卡账户中自动续费年费。建行会在年费到期前通过短信、电话或其他方式通知用户，并根据用户的选择，在到期日前自动从用户的账户中扣除相应的年费金额。
网点还款
用户可以直接去当地的银行网点进行还款。
约定账户还款
用户可以关联一张建设银行的借记卡，在还款日自动进行扣款。
自动终端还款
用户可以通过ATM存取款机，存入现金进行还款。
网上银行、手机银行还款
用户可以通过电脑或手机进行还款，这是最常用的还款方式之一。
柜台还款
用户可以在建设银行的柜台进行还款，需要提前将还款资金存入还款账户。
代扣业务
客户可以主动从一个或多个活期存款账户扣款，采用单笔代扣、批量代扣方式，并可实时代扣、预约代扣。付款方可以是单位或个人。
建议用户根据自身情况选择最便捷的还款方式，如选择自动续费功能可避免忘记还款，使用网上银行或手机银行则可以在任何时间进行还款。