办理停薪留职的步骤如下：
提交书面申请
员工需先向企业提交书面申请，说明停薪留职的原因和期限。
签署停薪留职协议
企业与员工签署停薪留职协议，明确双方的权利和义务，包括停薪留职期间的具体安排和待遇等。
备案
将停薪留职协议报备至企业主管部门和所在地劳动部门，以便进行审批和备案。
审批
企业需对员工的停薪留职申请进行审批。如果申请获批，员工即可开始停薪留职。
遵守协议条款
员工在停薪留职期间需遵守协议中的各项条款，包括停发工资、奖金和其他福利待遇，同时需按月缴纳待业保险基金、养老保险基金及其他费用。
期满后的处理
停薪留职期满后，员工应办理复工手续或提出辞职、调动申请。如果未办理任何手续，企业可按照自行离职处理，并发给离职证明书。
注意事项：
停薪留职期间，员工与原单位的劳动关系仍然存在，企业应支付一定的基本生活费用或当地最低工资标准的工资。
如果员工对停职决定不服，可以向当地劳动仲裁委员会申请仲裁，或通过法律途径解决纠纷。
建议员工在办理停薪留职时，仔细阅读并理解协议条款，确保自身权益不受损害，并在遇到问题时及时寻求法律援助。