申请办理停薪留职的流程通常包括以下几个步骤：
提出书面申请：
职工本人需向所在单位提出书面申请，说明申请停薪留职的理由和期限。
签订协议：
申请经单位行政领导批准后，职工与企业应签订“停薪留职”的协议书。
备案：
协议书需要报企业主管部门和当地劳动人事部门备案。
个体经营登记：
如果职工计划从事个体经营，必须凭协议书到当地工商行政管理部门办理登记手续。
缴纳劳动保险基金：
“停薪留职”人员在从事其他有收入的劳动时，原则上应按月向原单位缴纳劳动保险基金，数额通常不低于本人原标准工资的百分之二十。
工龄计算：
“停薪留职”期间计算工龄。
请注意，具体流程和要求可能因地区和单位政策而异，建议咨询所在单位的人事部门或法律顾问获取详细信息