农村合作医疗（农合）住院报销流程通常包括以下几个步骤：
住院登记
住院时出示身份证和社会保障卡，并预交一定费用。
到结账处登记并领取报销表格，交到科室护士站。
出院结算
出院时携带出院通知单、身份证、社会保障卡和预交款单原件。
可以由家属代办结算手续。
如果住院前已激活医保卡并确认医保信息，可以直接抵扣费用，无需拿发票回原户籍报销。
报销比例和限额
报销比例和限额根据医疗机构的级别有所不同。
审核流程
参保者将相关材料（住院发票、费用清单、出院记录和身份证）交到本乡镇合管所进行审核。
审核通过后，材料送至市农保业务管理中心。
报销款项转入
报销医疗费用将转入参保人指定的银行账户中。
特殊情形
对于特殊病种门诊报销或意外伤害住院，需要提交额外的证明材料，并按照特定流程申请。
请注意，以上流程可能因地区和政策更新而有所变化，建议直接咨询当地的社会保障机构以获得最准确的信息