公司申请发票的流程通常包括以下几个步骤：
税务登记
办理税务登记，取得税务登记证。
开票资格注册
向税务局提交企业资料，如营业执照、税务登记证等，并填写税务登记表格。
发票种类核定
携带税务登记证、办税员联系卡、发票专用章等材料，前往税务局核定发票种类。
领购发票
根据核定的发票种类，填写相关申请表格，如《纳税人票种核定申请表》，并提交至税务局。
税控系统申请
如果需要使用可抵扣的增值税专用发票，需申请成为一般纳税人，并购买税控系统。
发票购买
携带税控盘、申请表等相关材料，到税务局发行税控盘。
发票开具
在电子税务局或税务局窗口申请开具发票，并设置发票打印机。
发票销售账户
在政府税务网上开设发票销售账户，开始进行发票销售。
定期交税
完成税务申报，按时交纳税款，保证发票的正常使用和税务机关的抽查。
请注意，以上流程可能因地区或具体操作细节有所变化，建议直接咨询当地税务局获取最新信息。