新生儿参加新型农村合作医疗（新农合）的报销流程通常包括以下几个步骤：
办理户籍登记：
首先为新生儿办理户籍登记。
参保登记：
携带户口簿和监护人身份证原件到户籍所在乡镇（街道）办理城乡居民医保参保登记。
缴费：
根据缴费通知单到指定银行缴费。
办理市民卡：
户籍登记满15日后，监护人可以到制卡中心办理市民卡。
对于新生儿的医疗费用报销，根据不同情况，报销流程可能有所不同：
如果监护人在新生儿出生后已经帮助办理了参保登记和缴费手续，出院时可以直接刷卡报销。
如果新生儿未参保，出院后需要办理相关手续，然后携带病历本、医保卡、户口本等资料到社保经办机构申请报销。
对于在出生3个月以内申报登记新农合并缴费的新生儿，其在申报前发生的医疗费用，市社保中心会视同已经参保并给予报销。
一些地区可能允许在出生一段时间后再办理新农合参保，然后报销医疗费。
请注意，具体的报销比例和条件可能因地区而异，建议咨询当地社保经办机构获取最准确的信息