科目三补考费的缴费方式如下：
报名时交费
在初次报名时，需要支付包括科目三在内的所有考试费用。
线上支付
可以通过交通部门的官方网站或者驾校指定的电子支付平台完成线上支付。
考试中心支付
有些地方可能需要直接到考试中心或指定窗口缴纳现金。
通过驾校代缴
可以交给驾校，再由驾校统一交给当地交通部门。
建议
提前了解：建议提前了解所在地区的具体缴费方式和流程，以确保顺利缴费。
选择便捷方式：线上支付通常更为便捷，可以随时随地进行，避免到考试中心或驾校排队等候。
确认信息：在缴费前，务必确认所有信息准确无误，避免因信息错误导致缴费失败或影响考试。