村干部辞职应遵循以下程序：
提交书面申请
村干部个人以书面形式向上级党委（通常是乡党委）提出辞职申请。
申请中应明确辞职原因和条件。
乡党委审核
乡党委在接到辞职申请后，需对辞职原因、条件等进行核实，并提出初步审核意见。
审核过程中应听取所在村组的意见，并与村干部本人进行谈话。
村民会议表决
根据干部现任职务性质，可能需要召开村党员会议或村民代表会议讨论通过。
村民委员会需在三十日内召开村民会议或村民代表会议，决定是否接受辞职请求，并进行表决。
公告与备案
表决通过后，应在五日内进行公告。
辞职申请及相关材料需报镇人民政府和区民政部门备案。
补贴问题
对于离职补贴，必须经过村民评议，符合要求后，由村里两委会会议评议审核，最后上级党委部门审核，并且每道程序都进行公示，无异议后才能享受补贴。
法律依据
相关法律依据包括《中华人民共和国公务员法》和《中华人民共和国村民委员会组织法》。
请确保按照上述程序办理辞职，若有疑问，建议咨询当地民政部门或法律顾问