处理员工纠纷的方法如下：
协商解决
劳动争议发生后，当事人应首先尝试通过协商解决问题。协商可以消除矛盾，找到双方都能接受的解决方案。
企业调解
如果协商无果，当事人可以向本单位的劳动争议调解委员会申请调解。调解达成协议后，双方应自觉履行调解书，但调解书不具有法律约束力。如果调解不成，当事人可以在规定期限内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
申请仲裁
劳动争议一般由所在行政区域内的劳动争议仲裁委员会受理。当事人可以向劳动争议仲裁委员会提交申请书，仲裁委员会在收到申请后五日内作出是否受理的决定。如果受理，仲裁委员会将通知被申请人，并安排开庭审理。仲裁庭应在开庭前通知双方当事人，并先行调解。调解达成协议的，制作调解书；调解未达成协议的，仲裁庭应及时裁决。
法院诉讼
当事人对仲裁裁决不服的，可以在收到裁决书之日起15日内向当地人民法院提起诉讼。法院审理后，可以作出民事调解书或判决书。调解书或判决书具有法律效力，当事人应依照规定的期限履行。
预防措施
预防纠纷的发生是关键。企业应营造积极、和谐、公平的工作环境，制定清晰明确的规章制度，加强团队建设，定期组织员工活动，增进彼此了解与信任。
建议：
企业应重视纠纷的预防和处理，建立完善的内部沟通和调解机制，及时化解员工之间的矛盾和纠纷，维护良好的工作氛围和企业形象。