公积金还房贷的扣款方式主要有以下几种：
直接扣款
从银行卡扣款：在办理公积金贷款时，需要绑定一个自己的银行卡，到了还款日系统会从绑定的银行卡里面扣款。
从公积金账户扣款：这种也叫做公积金冲还贷，委托银行提取个人公积金账户余额里的钱去还贷款月供。这种方式下，系统会优先扣除公积金余额，当公积金余额不够时，再从指定银行卡内进行扣费。
自动扣款
按月自动扣款：借款人和配偶可以申请使用个人公积金账户可用余额按月自动扣划还款。办理代扣业务后，住房公积金贷款每月自动扣款顺序为：借款人个人公积金账户可用余额、借款人配偶个人公积金账户可用余额、借款人签约银行还款账户。
年冲方式：住房公积金对冲还贷业务可以选择年冲，即每年一次性扣除公积金账户余额用以冲抵应还本金，冲抵后月还款额将重新计算，后续客户再按时逐期还款。
建议
提前存款：在还款日前，建议提前将当期应还的贷款金额存入个人公积金账户或绑定的还款银行卡中，以确保扣款成功。
确认扣款顺序：了解并确认公积金扣款顺序，以便合理安排资金。
关注余额：确保公积金账户和还款银行卡余额充足，避免因余额不足导致扣款失败或逾期。
通过以上方式，可以确保公积金还房贷的扣款过程顺畅，避免不必要的麻烦。