在神州租车使用车辆时，如果发生交通违章，需要按照以下步骤处理扣分：
现场抄牌
如果违章被交警现场抄牌，您需要携带交警开具的罚单，在15天内前往抄牌所在地的交警大队缴纳罚款。现场抄牌通常会导致扣分。
逾期处理
如果您未在规定的15天内处理违章，将会产生违约金。违约金按200元/天的标准计算，最高不超过6000元。
遗失证照或车辆被扣
如果因用户遗失证照或违法违规用车导致车辆被扣，客户除了需要支付违约金外，还需向神州租车支付停运损失费。
建议您在使用车辆时严格遵守交通规则，避免违章，以免产生不必要的费用和麻烦。