科三缺考的处理方法如下：
提前申请取消预约
如果考生因故不能按照预约时间参加考试，应当提前一日申请取消预约。
取消预约的方式可以是本人携带身份证档案到车管所办理，或者通过网上取消预约。
如果未提前取消预约且未按预约时间参加考试，则会被判定为考试不合格。
重新报考并缴纳补考费用
科目三缺考后，考生可以在规定时间内重新报名并缴纳一定的补考费用。
重新报名后，考生需要按照新的考试时间参加科目三考试。
提供缺考原因证明
如果因特殊原因（如因病、怀孕、出国等）无法参加考试，考生需要提供相关证明文件（如医院证明、复诊证明等），并按规定提交相关材料。
合理安排时间
考生在重新报考后应好好计划时间，确保不再出现迟到等情况，争取在下一次考试中取得好成绩。
了解当地规定
不同地区对于科三缺考的处理规定可能会有所差异，建议考生及时咨询当地驾校或车管所，了解具体处理流程和规定。
总之，科三缺考会导致考生被判定为不合格，浪费一次考试机会，但考生可以通过提前申请取消预约或重新补考来解决问题。建议考生在考试前合理安排时间，确保能够按时参加考试，避免不必要的麻烦。