在日本卖房时，需要交纳的税种和税率如下：
譲渡所得税 （类似于资本利得税）：短期持有（5年以内）
所得税：30%
住民税：9%
合计税率：39%
长期持有（超过5年）：
所得税：15%
住民税：5%
合计税率：20%
特别控除：
自住房产持有10年以上，且所得利益不超过6000万日元部分，税率为14.21%
印花税
根据合同中标明的卖房金额来决定，金额越大，印花税越高。
常见的印花税率如下：
1000万日元至5000万日元：1万日元
5000万日元至1亿日元：3万日元
1亿日元至5亿日元：6万日元
登记免许税
这项税费由买方支付，卖主不需要支付。
不动产取得税
在购买房产三个月后缴纳，税率为土地固定资产评估价的3%加上建筑固定资产评估价的4%。
固定资产税 和 都市计划税
每年需要支付，分别为土地固定资产评估价的1.4%和房产评估价的1.4%，以及土地评估价的0.3%和房产评估价的0.3%。
源泉征收税
非日本居住者出售房产时，可能需要支付房产买卖金额的10.21%作为源泉征收税，但满足一定条件（如买方为个人、购买自住房且金额不超过1亿日元）可免除。
建议
持有时间：如果房产持有时间超过5年，所得税和住民税的税率分别为15%和5%，远低于短期持有的39%。
自住房产：如果房产用于自住且持有时间超过10年，可以享受6000万日元以下部分14.21%的税率。
非日居住者：需要特别注意源泉征收税的规定，以避免额外费用。
建议在卖房前仔细计算各项税费，并咨询专业的税务顾问以确保合规。