当公司被审计时，处理流程通常包括以下几个步骤：
审计准备 ：审计机关会对公司进行财务收支等方面的审计。审计实施：
审计过程中，审计机关会检查公司的财务报表、会计凭证、账簿等，核实其真实性、完整性。
审计报告：
审计结束后，审计机关会出具审计报告，列出发现的问题和建议。
问题处理
对于违反财经法规、政策、计划的行为，审计机关可采取以下措施：
警告、通报批评；
责令纠正违反国家规定的收支；
责令退还或没收非法所得；
收缴侵占的国家资产；
停止财政拨款或银行贷款；
处以罚款；
责令限期退还被侵占的国有资产；
责令冲转或调整有关会计账目；
提出其他纠正措施。
整改与监督
被审计单位需要根据审计报告进行整改，并在规定时间内提交整改报告。
审计机关会对整改情况进行检查和督导。
如果被审计单位未按时整改或整改不到位，审计机关可采取进一步的措施，如约谈主要负责人。
法律途径
如果被审计单位对审计决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
对于审计人员的不当行为，如滥用职权、徇私舞弊等，将依法给予处分，严重者追究刑事责任。
以上步骤概述了公司被审计后的处理流程。需要注意的是，具体处理措施可能因实际情况和当地法律法规的不同而有所变化。如果您需要更详细的信息，请提供具体问题或情况