在深圳办理健康证，可以遵循以下流程：
选择办理地点
深圳市疾病控制中心（原深圳市卫生防疫站）。
坪山区人民医院、坪山区妇幼保健院。
罗湖区人民医院、罗湖区清水河街道社区健康服务中心等。
准备材料
本人身份证或其他有效证件。
用人单位开具的工作证明或营业执照复印件（部分机构需要）。
办理流程
到办证大厅交费并领取体检表。
用正楷字在体检表的上下两联填写姓名、性别、年龄、工程（职业类别）。
在体检室进行照相、体检。
胸透（孕妇免）。
计划免疫科打麻疹疫苗（孕妇免）。
抽血化验（食品、公共场所从业人员加做肛检）。
体检结束后，凭体检表上联、发票绿色联、培训试卷取证。食品、公共场所从业人员体检48小时后取证。
注意事项
办理健康证没有特定的条件要求，需要此证件的市民都可以办理，不分本地户口和外地户口。
体检前记得带上身份证和单位开具的工作证明。
体检结果通常在5个工作日内可以查询，如体检未发现异常即可办理健康证。
建议提前电话预约相关医疗机构，确认所需材料和流程，以确保顺利办理健康证。