差额纳税的计算方法如下：
计算销售额
销售额 = 含税销售额 - 销售额折扣 - 销售不含税额。
计算进项税额
进项税额 = 购进含税额 × 税率。
计算应纳税额
应纳税额 = 销售额 - 进项税额。
对于一般纳税人和小规模纳税人，计算公式稍有不同：
一般纳税人：
计税销售额 = （取得的全部含税价款和价外费用 - 支付给其他单位或个人的含税价款） / （1 + 对应征税应税服务适用的增值税税率或征收率）。
小规模纳税人：
计税销售额 = （取得的全部含税价款和价外费用 - 支付给其他单位或个人的含税价款） / （1 + 征收率）。
请注意，差额纳税的纳税人只能抵扣进项税，而不能享受抵扣其他税费的权利