单位可以通过以下几种方式查询员工的学历信息：
学历证书核实：
要求员工提供学历证书原件或复印件，并仔细核查证书的真伪、学校名称、毕业时间等信息。
在线学历查询：
通过教育部学信网或学校官网查询员工的学历信息。
第三方学历认证机构：
利用第三方学历认证机构或学位证书查询网站进行查询。
联系学校：
直接联系员工毕业的学校，核实员工的学历是否真实有效。
社会认可的学历认证：
要求员工通过社会认可的学历认证机构进行认证。
使用第三方查询工具：
如果有资源，可以使用与政府教育部相关部门或认证机构联系的第三方查询工具。
要求打印学历证明：
要求员工在学信网上打印学历报告，特别是对于毕业时间较短的员工，可能免费，超过半年则可能收费。
单位会员查询：
通过“学信就业”平台进行“单位注册”后进行查询。
请根据具体情况选择合适的查询方式。需要注意的是，查询时应确保使用正规渠道，并注意保护个人隐私。