农村机动地的确权程序如下：
提出申请
相关农户可以提出申请，请求对机动地进行调整分配。
民主协商和村民议决
申请需要经过民主协商和村民议决，决定是否对其给予机动地的调整分配。
条件限制
如果农村集体经济组织没有集体预留机动地或新开垦土地等可用于调整分配的土地，则暂不进行土地确权登记颁证。
法律依据
《农村土地承包法》第二十九条规定，机动地应当用于调整承包土地或者承包给新增人口，包括依法预留的机动地和通过依法开垦等方式增加的土地。
确权登记
如果机动地依法合规承包给了新增人口，应当按家庭承包方式确地确权到户，并颁发承包经营权证书。
如果农户已取得的二轮承包合同和承包经营权证书上又出现了机动地的情形，这些机动地不能确权登记给原承包户，而应依法依规用于调整土地或分配给新增人口，并确地确权到户，颁发证书。
建议：
农户在申请机动地确权时，应确保按照法律规定的程序进行，包括民主协商和村民议决等步骤。
集体经济组织在处理机动地确权时，应严格按照《农村土地承包法》的规定，确保机动地用于调整土地或承包给新增人口。
对于已经承包给新增人口的机动地，应及时办理确权登记，并颁发相应的承包经营权证书，以保障农民的合法权益。