工程税费的计算通常遵循以下步骤：
1. 确定适用的税率。这取决于工程项目的性质，可能包括增值税、企业所得税等。
2. 计算工程项目的收入总额，通常是工程合同金额减去预付款等。
3. 根据确定的税率对收入总额进行计算，得出应纳税额。
4. 根据税收政策，可能还需扣除一些减免税项，如进项税额、减免税额等，以确定实际应缴纳的税费。
具体的计算公式为：
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应纳税额 = 收入总额 × 税率 - （进项税额 + 减免税额）
```
例如，如果一个工程的收入为1000万元，适用的增值税率为13%，进项税额为100万元，减免税额为50万元，则应纳税额为：
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（1000 × 13% - 100 - 50） = 135万元
```
请注意，税法的具体规定可能随时间和地区的不同而有所变化，因此在实际计算时应以最新的税法规定为准。