撤销工伤认定申请可以通过以下步骤进行：
在社保行政部门作出决定前
申请人可以直接向社保行政部门提交一份书面的撤回工伤认定申请。
社保行政部门作出决定后
申请人可以通过申请行政复议或提起行政诉讼的方式来撤销工伤认定决定。
行政复议：在接到工伤认定决定通知书之日起60日内，可以向本级人民政府或上级社会保险行政部门申请行政复议。
行政诉讼：收到工伤认定决定书之日起六个月内，可以向人民法院提起行政诉讼要求撤销工伤认定申请。
特殊情况
如果工伤认定申请的材料不齐全，劳动部门可能还没有判定依据，此时可以撤销申请。
请根据具体情况选择合适的撤销流程。