增值税一般纳税人在支付运输费用时，可以根据以下方式抵扣进项税额：
增值税专用发票
从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额，可以用于抵扣销项税额。
海关进口增值税专用缴款书
从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额，同样可以用于抵扣。
代扣代缴税款的完税凭证
从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额，也可以用于抵扣。
运费发票
根据运费发票所列运费金额（不包括随同运费支付的装卸费、保险费等其他杂费）乘以适用的扣除率计算抵扣进项税额。根据最新的规定，适用的扣除率可能是7%或11%。
计算公式：
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准予抵扣的进项税额 = 运费金额 × 扣除率
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请根据您的情况选择合适的抵扣方式，并确保遵循最新的税法规定。需要注意的是，税法规定可能会有更新，因此建议咨询当地税务机关或专业税务顾问以获取最准确的信息