当企业面临进项发票过多的情况时，可以采取以下几种方法进行处理：
暂估入库法
将多余的进项发票留在手中不认证不入账，库存作暂估入库。
次月再对这些发票进行认证，并冲减暂估入库，然后按发票入账。
抵扣法
将多余的进项发票全部认证抵扣，并在“增值税纳税申报表”中做上期留抵税额。
如果企业有销售产品，即使不开具发票销售，也需要计提销项税，这样会减少上期留抵税额。
待认证进项税额法
将取得的专票上记载的税额计入“应交税费-待认证进项税额”，不含税的金额计入成本费用科目，价税合计数计入“应付账款”等科目。
后期认证并申报抵扣时，将对应的税额从“应交税费-待认证进项税额”贷方转入“应交税费-应交增值税（进项税额）”借方。
与供应商协商
如果进项发票数量超过实际交易数量，可以与供应商协商，请求提供正确的发票数量或等待新的发票。
退回多余发票
如果与供应商协商无果，可以退回多余的发票，并确保保存好以备未来可能的审计或查询。
冲减成本或费用
如果无法退回多余的发票，可以考虑用这些发票抵扣正常的经营成本。
计入待处理财产损益
如果以上措施都不可行，可以将多余的发票计入待处理财产损益，这是一种会计处理方式，可以在一定程度上减少企业的损失。
财务管理体系优化
建立健全的财务管理体系，包括制定详细的发票管理制度，明确各部门职责分工，并定期对财务人员进行培训。
引入财务管理软件，如用友畅捷通，实现发票信息自动录入、分类、查询等功能，提高工作效率。
加强内部审计与监督
设立专门的审计小组，定期对发票管理流程进行审查，发现问题及时纠正，并完善相关制度。
税务咨询
如果企业长期进项发票过多，可能需要找专业的财务机构进行税务咨询，确保合法合规的节税。
请注意，处理多余的进项发票时要确保符合税法规定，避免税务风险。