增值税一般纳税人支付运输费用时，可以根据以下方式抵扣增值税：
增值税专用发票
从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额可以直接抵扣。
海关进口增值税专用缴款书
从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额也可用于抵扣。
代扣代缴税款的完税凭证
从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额可以用于抵扣。
运费发票
根据运费发票所列运费金额乘以规定的扣除率计算进项税额。扣除率可能因时间和政策调整而变化，请参考最新的税法规定或咨询当地税务机关。
其他相关费用
随同运费支付的装卸费、保险费等其他杂费通常不得计算抵扣进项税额。
请根据最新的税法规定和您所在地区的具体政策进行操作，并咨询当地税务机关以获取最准确的信息