土地增值税的缴纳流程和计算方式如下：
缴纳流程：
办理税务登记
土地转让双方应在土地转让合同签订之日起30日内，前往当地税务部门办理税务登记，并领取《税务登记证》。
缴纳土地增值税
土地转让完成后，转让受让方应在30日内，持税务登记证、土地转让合同等相关材料到当地税务部门缴纳土地增值税。
确认税款
税务部门会对纳税人缴纳的土地增值税进行核算，如果存在差异，会通知纳税人进行补缴或退税。
纳税申报表
需要填写土地增值税纳税申报表，并按照相关规定进行申报和缴纳。
计算方式：
计算增值额
增值额 = 转让收入额 - 扣除项目金额。
计算适用税率
根据增值额与扣除项目金额之比，按照四级超率累进税率征收。
计算税额
增值额未超过扣除项目金额50%：税额 = 增值额 × 30%。
增值额超过扣除项目金额50%，未超过100%：税额 = 增值额 × 40% - 扣除项目金额 × 5%。
增值额超过扣除项目金额100%，未超过200%：税额 = 增值额 × 50% - 扣除项目金额 × 15%。
增值额超过扣除项目金额200%：税额 = 增值额 × 60% - 扣除项目金额 × 35%。
注意事项：
纳税人应向房地产所在地主管税务机关办理纳税申报，并在税务机关核定的期限内缴纳。
如果纳税人能提供合法有效的房屋购买合同、发票等房产原值凭证，以及规定扣除项目及费用相关凭证的，可以按照核实征收方式计征土地增值税。
如果纳税人不能提供合法、有效的凭证，税务部门将以核定征收的方式征收土地增值税。
请根据具体情况选择合适的缴纳方式和计算方式，并遵循当地税务部门的规定进行操作