办理特殊病种医保的流程通常包括以下几个步骤：
就诊与诊断
携带既往病史资料（如出院记录、化验单、疾病相关检查报告单等）至二级及以上医疗机构的专科医生就诊。
由医生填写基本医疗保险特殊病种证明及门诊治疗审批表。
医院办理
特殊病种审批表必须由二级以上定点医疗机构经治医师填写。
医院办理完结后，患者或家属需携带病史资料、医保卡、身份证（未成年人持户口本）和1寸照片2张到医院医保办领取特种病种的门诊申报单，并填写完整后盖上医院医保办的公章。
社保所申请
将盖好章的申报单拿回户籍所在地的社保所申请，领取并填写申请表。
审批表到当地社保局审批并盖章。
备案与享受待遇
将审批通过的申请表和审批表拿回医院，由医院进行备案。
办理完成后，患者在医院看病时可以享受特殊病种的待遇。
请注意，以上流程可能因地区而异，具体操作步骤和所需材料请以当地医保政策为准。