工程增值税的抵扣遵循以下基本步骤和规则：
确定销项税
销项税是根据工程结算金额乘以适用的增值税率计算的。例如，如果适用的增值税率是11%，则销项税 = 工程结算金额 × 11%。
确定进项税
进项税是指企业在购买原材料、服务等过程中取得的增值税专用发票上注明的税额，这些税额可以用来抵扣销项税。
只有用于增值税应税项目的进项税额才能用于抵扣。
取得和认证发票
企业需要取得符合规定的增值税专用发票，并在规定的时间内进行认证，才能进行进项税额的抵扣。
抵扣过程
在取得进项发票后，应在规定的纳税申报期内，向主管国税机关申报抵扣进项税额。
注意事项
用于个人消费或集体福利的进项税额不能抵扣。
发票上应注明建筑服务发生地的县（市、区）名称及项目名称，并确保“货物、劳务及服务流”、“资金流”、“发票流”三流一致。
一般纳税人取得的增值税专用发票，在认证通过后可以用于抵扣。
特殊规定
根据财政部、税务总局、海关总署公告2019年第39号的规定，从2019年4月1日起，已经取消的分2年抵扣的限制，可以一次性进行抵扣。
请根据最新的税法规定和实施细则进行操作，因为税法可能会有更新和变化。