员工缴纳个人所得税的方式通常有以下几种：
扣缴制度
员工所在单位在发放工资之前，会先到税务机关办理代扣代缴手续。
财务人员根据员工工资计算出应缴纳的税款，并在发放工资时扣除税款后发放给员工。
自行申报
如果员工没有扣缴义务人，或者扣缴义务人未依照税法规定代扣代缴税款，员工需要自行向税务机关申报纳税。
员工可以在税务局网站上注册账号，登录后进行个人所得税明细申报，填写相关信息后申报并缴纳税款。
计算公式
应纳税所得额 = 税前工资收入金额 - 五险一金（个人缴纳部分） - 费用减除额。
应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数。
个税起征点为每月5000元。
年度汇算清缴
员工在年度结束后，可能需要进行年度汇算清缴，以确认全年的税款是否正确，多退少补。
请根据您的具体情况选择合适的缴税方式。