外贸公司在进行交易时需要缴纳的主要税费包括：
增值税
出口货物一般可以享受增值税退税政策。
进口环节增值税：进口货物需要缴纳。
国内交易增值税：国内生产经营活动中发生的应税销售行为需要缴纳。
关税
进口货物需要缴纳关税。
消费税
出口的应税消费品一般可以退还或免征消费税。
进口的应税消费品需要缴纳进口环节的消费税。
企业所得税
企业在生产经营活动中取得的应纳税所得，按照规定税率缴纳。
其他税费
城市维护建设税：根据企业缴纳的流转税（如增值税、消费税）规定比例缴纳。
教育附加税：根据企业缴纳的流转税规定比例缴纳。
地方教育附加税：根据企业缴纳的流转税规定比例缴纳。
印花税：对于签订的合同、发票等，需要按照规定缴纳。
土地使用税、房产税、车船税：如果公司拥有土地、房产、车辆等固定资产，则需要缴纳相应的税款。
个人所得税
公司支付给个人的薪资、津贴、奖金等需要缴纳个人所得税。
出口退税的具体操作包括：
先按规定缴纳增值税。
出口手续办理完成后，携带出口退税的相关单证，如实填写申报表，再向税务机关办理退税手续。
请注意，税收政策可能会有变动，因此外贸公司需要密切关注相关政策，确保合规经营。