企业年报的修改流程如下：
确认修改时间限制：
企业年报的修改需要在每年的1月1日至6月30日之间进行。如果已经超出了这个时间限制，通常无法直接修改，但可以向市场监督管理局提出修改申请。
提交修改申请：
如果需要修改年报，企业应向市场监督管理局提出修改申请。申请中应包含详细的修改原因，如报告中的错误或新增内容。
等待审批：
市场监督管理局收到申请后，会根据提供的内容进行处理，并给出审批结果。
公示修改信息：
一旦申请被批准，原先公示的信息将被撤销，并公示修改后的信息。修改前后的信息应同时展示，以便公众对照。
请注意，修改年报时应尽量一次性提交所有需要更正的内容，以减少不必要的麻烦。