违法所得的认定主要遵循以下原则和步骤：
手段违法性 ：违法所得必须是通过法律禁止的手段获得的，这是其基本特征，也是区分违法所得与合法财产的关键。经济价值：
违法所得具有经济价值，这是执法部门进行认定的一个重要衡量标准。
扣除合理支出：
在认定违法所得时，应当扣除直接用于经营活动的合理支出。具体操作中，可以参照《工商行政管理机关行政处罚案件违法所得认定办法》，该办法规定，以当事人违法生产、销售商品或者提供服务所获得的全部收入，扣除当事人直接用于经营活动的适当的合理支出，为违法所得。
总额说与净额说
总额说：
认为违法所得是全部违法收入，包括成本和收入。在食药领域和动物防疫领域，执法部门一般采用这一观点。
净额说：认为违法所得是扣除合理支出后的净所得。在工商领域，执法部门一般采用这一观点。
特定机关的认定 ：违法所得的认定只能由国家授权的特定机关通过一定的程序进行，以确保执法的公正性和准确性。不同情况下的具体认定
对于非法经营犯罪，违法所得是指获利数额，即违法生产、销售商品或者提供服务所获得的全部收入扣除直接用于经营活动的合理支出后的剩余数额。
在某些特定情况下，如侵犯公民个人信息案件，违法所得的认定可能不扣除成本。
市场因素的影响：
在认定违法所得时，还应当考虑市场因素的影响，如交易价差、余券价值等，同时剔除正常交易成本。
综上所述，违法所得的认定是一个复杂的过程，需要综合考虑多种因素和程序。在实际操作中，应当根据具体案件的情况和相关法律法规的规定，进行准确的认定和处理。