大巴超员的计算方法如下：
按座位定员
客车按照座位数定员，有多少座位就只能坐多少人。严格来说，超过一个人就算超载。
超员率计算
超员率可以通过以下公式计算：超员率 = 超出的人数 ÷ 规定可坐人数。例如，一辆40座的大巴，如果多坐了2人，超员率为：2 ÷ 40 = 5%。
超载百分比
超载百分比也可以表示为：超载百分比 = （实际载客数量 - 额定载客数量） ÷ 额定载客数量 × 100%。例如，如果一辆大巴实际载客42人，额定载客40人，则超载百分比为：（42 - 40） ÷ 40 × 100% = 5%。
处罚标准
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，公路客运车辆载客超过额定乘员的，处200元以上500元以下的罚款；超过额定乘员20%或者违反规定载货的，处500元以上2000元以下的罚款。此外，对于驾驶营运客车超过核定人数20%以上的，一次记12分。
建议
驾驶员和乘客应严格遵守交通法规，避免超载，以确保行车安全，减少交通事故的风险。
交通运输管理部门也应加强监管，对超员车辆进行严厉处罚，以维护正常的交通秩序。