支票存根盖章的步骤如下：
1. 确保支票存根平整无皱褶，平铺在桌面上。
2. 将公章或财务章放置在存根上需要盖章的位置，印章面朝上。
3. 使用右手握住印章的把手，左手轻轻按住存根，缓慢而均匀地用力向下按压。
4. 注意用力要适中，避免印章歪斜或压痕不清晰。
5. 印章压印完成后，轻轻抬起印章，检查存根上的印章是否清晰且位置正确。
6. 确认印章边缘与存根边缘对齐，保持盖章位置的整齐。
7. 盖章过程中避免印章与存根接触时间过长，防止印泥干燥或沾污存根。
8. 仔细检查印章是否完整清晰，确保盖章无误。
请根据具体情况调整盖章的位置和力度，以保证印章效果。