当公司决定撤销某个部门时，处理员工的步骤通常包括以下几点：
透明沟通
向受影响的员工解释部门撤销的原因和必要性。
描述公司计划的下一步动作，包括可能的岗位变动。
提供调岗选项
根据员工技能和公司的需求，提供合理的调岗机会。
确保新岗位与员工能力相匹配，且薪资福利不会大幅降低。
提供必要的培训或过渡支持，帮助员工适应新角色。
协商一致
与员工个别或集体协商，尝试达成共识。
在调岗、工作地点、工作时间等方面做出灵活安排。
经济补偿方案
如果员工拒绝调岗，且公司没有合适的岗位提供，可能需要给予经济补偿。
补偿标准通常为每满一年支付一个月工资，不足半年按半个月计算。
法律咨询
在整个过程中，咨询法律顾问，确保每一步操作符合当地劳动法律法规。
心理支持
提供心理咨询服务或组织团队建设活动，帮助员工应对工作变动带来的压力。
书面记录
所有沟通和协商过程应有书面记录，为可能出现的争议提供证据。
灵活处理特殊情况
针对孕期、医疗期等特殊情况的员工，需要更加人性化和灵活的处理方式。
业务交接方案
明确交接内容，制定交接计划，清晰界定被撤销部门所负责的业务范围和职责。
对负责业务交接的人员进行培训，确保他们了解业务内容和流程。
监督与审核
对业务交接过程进行监督和审核，确保交接工作准确无误。
如果员工不同意调岗，公司不能强行调整岗位，否则可能构成违反劳动合同的行为。在这种情况下，员工可以尝试与用人单位协商，或者向劳动监察部门投诉，甚至向劳动争议仲裁委员会提起诉讼。
请根据具体情况采取相应措施，并确保遵守当地劳动法律法规