当档案被涂改时，可以采取以下措施进行处理：
通知相关部门
立即通知档案管理部门或人事部门，并说明涂改情况。
现场确认
请求相关部门进行现场确认，核实涂改痕迹的真实性。
补充材料
如果涂改是由于缺少或错误材料，补充相关材料以证明档案的真实性。
申请复印件
获取涂改档案的复印件，并在复印件上标注原件存在涂改痕迹。
申请补正
如果涂改是由于档案管理部门的失误，向相关部门申请更正错误信息。
重新密封和盖章
如果档案外壳被撕开但内部材料未受影响，可以重新密封并盖章。
补办材料
如果内部材料出现涂改，需要回到原单位或学校补办相关材料。
法律后果
对于篡改或伪造个人档案的行为，可能会受到行政处分或刑事责任追究。
身份验证
在必要时，使用身份证或派出所证明重新认定出生日期等敏感信息。
档案保管
将档案存放在人才中心或具有档案管理资质的机构。
请根据具体情况选择合适的处理方式，并确保遵循相关法律法规和程序。