检察院撤销案件的流程通常包括以下几个步骤：
决定撤案
如果是检察院自己提出的案件，可以直接撤销。
如果是公安局立的案件，检察院只能提出建议撤销，由公安机关根据相关程序决定是否撤销。
法律依据
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条规定，在特定情形下，如情节显著轻微、犯罪已过追诉时效期限、经特赦令免除刑罚等，可以撤销案件。
撤销案件的条件
情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的。
犯罪已过追诉时效期限。
经特赦令免除刑罚的。
依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的。
犯罪嫌疑人、被告人死亡的。
其他法律规定免予追究刑事责任的情形。
撤销案件的流程
检察机关作出撤销案件的决定。
公告撤案决定。
通知被告人。
对被告人进行必要的赔偿（如果有的话）。
案件结案。
特别规定
如果检察院在办理直接立案侦查案件过程中发现不应追究刑事责任，可以决定撤销案件。
如果犯罪嫌疑人已被逮捕，应当立即释放，并发给释放证明，同时通知原批准逮捕的人民检察院。
请注意，撤案的具体操作可能因案件的具体情况和当地的法律规定而有所不同。如果您需要更详细的信息，建议咨询专业的法律人士