企业补缴社保和公积金的流程如下：
确认劳动关系
确认员工与公司之间存在劳动关系，如果缺少劳动合同，可以向公司索要或向劳动仲裁机构申请确认劳动关系。
准备相关证明材料，如工资流水、考勤记录等，以证明劳动关系的存在。
确认补缴基数
确保补缴基数准确无误，基数将直接影响补缴金额。
准备工资流水和纳税证明等证明材料，以反映员工的真实收入情况。
正式操作补缴申请
通过社会保险经办机构或社保网上服务平台，将用人单位及职工的相关信息导入本地社保系统。
在社保系统中录入补缴信息，并导出社保补缴文件，打印相关表格并加盖公章。
将相关材料提交给社保机构审核，审核通过后，扣除社保费用及滞纳金，完成补缴。
公积金补缴
单位需要填写公积金管理中心统一印制的《公积金补缴书》和《公积金补缴清册》，并准备与补缴金额一致的转账支票。
将上述材料提交给公积金管理中心业务网点进行审核，审核通过后，办理补缴手续。
建议
提前咨询：在补缴社保和公积金前，建议先咨询当地的社保和公积金管理机构，了解具体的政策和所需材料，以确保补缴流程顺利进行。
准备充分：确保所有必要的证明材料齐全，并按照要求格式准备，避免因材料缺失或格式不正确而延误补缴进度。
及时沟通：与公司内部相关部门保持沟通，确保所有人员都了解补缴流程和所需材料，避免因内部沟通不畅导致补缴失败。