当企业发现存货盘亏时，应采取以下步骤进行处理：
立即进行现场盘点
确认实际存货数量与账面记录的差异。
填写盘点报表和盘亏表
记录盘点结果，进行统计分析，追踪账面和实际数据的差异，并提取经验教训。
建立存货计量和监督制度
确保存货管理质量，保证存货存量与账面记录一致。
严格记录损失原因
查明原因，找出损失原始数据，并记录在现场检修报告中。
加强存货安全管理
采取安全存储要求和仓库现场盘货等措施，确保存货安全。
会计处理
对于盘亏的存货，借记“待处理财产损溢”科目，贷记“原材料”、“库存商品”等科目。
根据造成盘亏的原因，进行相应的会计处理，如扣除残料价值、保险赔偿和过失人赔偿等。
税务处理
根据国家税务总局相关规定，只有会计上已作损失处理的，才能在当年度申报税前扣除。
分析原因并采取预防措施
分析盘亏原因，采取改进仓库管理和操作、提高记录准确性、加强安全措施等措施防止类似情况再次发生。
请根据具体情况，遵循相关会计准则和税法规定，进行恰当的会计和税务处理。