公司投资款的会计分录主要涉及以下几个方面：
短期投资
购入股票、债券、基金等作为短期投资时，按实际支付的价款进行会计分录：
借：交易性金融资产——股票、债券、基金
贷：银行存款或其他货币资金
长期股权投资
购入长期股权投资时，按实际支付的价款进行会计分录：
借：长期股权投资——公司
贷：银行存款
接受投资款
公司收到股东投入的投资款时，计入实收资本科目：
借：银行存款
贷：实收资本——XX股东
对外投资
对外投资分为以银行存款对外投资、股票或证券和固定资产对外投资，会计分录分别如下：
银行存款对外投资：
借：长期股权投资
贷：银行存款
股票或证券对外投资：
借：交易性金融资产
贷：银行存款
固定资产对外投资：
借：固定资产清理
累计折旧
贷：固定资产
发生清理费用或变价收入时：
借：固定资产清理
贷：银行存款或现金
投资产生盈亏时：
借：固定资产清理
贷：营业外收入
借：营业外支出
贷：固定资产清理
非现金资产投资
接受固定资产或无形资产投资时：
借：固定资产或无形资产（按公允价值入账）
应交税费——应交增值税（进项税额）
贷：实收资本（按双方约定的份额）
资本公积——资本溢价（差额倒挤）
投资款转还
公司100万投资款要转还投资人时，按以下方式处理：
借：实收资本
贷：银行存款
这些会计分录涵盖了公司投资款在不同情况下的处理方法，包括短期投资、长期股权投资、接受投资款、对外投资以及非现金资产投资等。建议在实际操作中根据具体业务类型和会计准则进行准确处理。