当遇到发票比对不符的情况时，您可以按照以下步骤进行处理：
确认问题
首先确认是否在申报过程中出现了比对不符的情况，并且是否被系统强制提交。
修改申报表
如果存在比对不符，您可以通过修改自行申报表来消除比对事项。
前往办税服务厅
如果自行修改申报表无法解决问题，建议携带相关资料前往办税服务厅进行核查和解决。
发票金额不符的处理
如果发票金额与实际报销金额不符，可以根据具体情况处理：
如果发票金额小于实际金额，可以补开增值税发票。
如果发票金额大于实际金额，且发生在当月，可以将原发票作废，然后按正确数据重新开具。
从软件层面解决
考虑升级或更换发票系统软件，或加入准确性和一致性的校验机制。
联系软件开发商获取技术支持。
从员工角度解决
加强员工对发票系统的培训，提高操作准确性和细心度。
建立有效的纠错机制，比如奖励政策。
从管理层面解决
增加对财务管理的投入，提高财务管理效率。
为财务人员提供更好的工作环境和设备。
请根据具体情况选择合适的解决方式。