公司报销医疗费用的流程如下：
收集必要资料
身份证或社会保障卡的原件；
定点医疗机构专科医生开具的疾病诊断证明书原件；
门诊病历、检查、检验结果报告单等就医资料原件；
财政、税务统一医疗机构门诊收费收据原件；
医院电脑打印的门诊费用明细清单或医生开具处方的付方原件；
定点药店：税务商品销售统一发票及电脑打印清单原件；
如果是代人办理，则需要提供代办人身份证原件。
提交报销申请
带齐以上资料到当地社保中心相关部门申请办理，经审核，资料齐全、符合条件的，就可以即时办理。
填写公司提供的报销申请表，包括病历记录、医疗费用明细、发票等，并在申请表上签字确认。
将报销申请表和相关单据提交给公司的人力资源部门或者财务部门。
审核与核发
公司的人力资源部门或者财务部门将会对员工的报销申请表进行审核和核发，如果符合要求，会进行报销处理，并将费用退回员工的银行卡中。
注意事项
报销时先扣除本社保年度内划入医疗保险个人帐户的金额，再核定应报销金额。
一般自费药、外购药医疗保险是不能进行报销的。
员工需要先到医院或者诊所进行治疗或者购买药品，确保医疗费用的真实性和合法性。
报销单据需按公司规定格式填写，并由相关人员签字确认及审核。
通过以上步骤，员工可以顺利完成医疗费用的报销。建议公司在处理报销事宜时，确保所有资料齐全、准确，并按照公司规定的流程操作，以便顺利获得报销款项。