合作社开具发票的步骤如下：
税务登记与发票领取
农民专业合作社需到主管国税机关办理税务登记，接受税务管理，并领取普通发票。从2009年起，合作社也可以申请认定增值税一般纳税人，从而开具增值税专用发票。
申请成为一般纳税人
若合作社希望开具增值税专用发票，需向主管税务机关提出申请，并提供相关证件资料，如税务登记证副本、经办人身份证明、财务专用章或发票专用章印模等。经审批后，税务机关将核发《发票领购簿》。纳税人凭《发票领购簿》及经办人身份证明，按核定的票面金额、数量和购票方式到主管国税机关领购发票。
开具发票
合作社销售本社成员生产的农业产品，视同农业生产者销售自产农业产品，免征增值税。若合作社销售非本社成员生产的农业产品或提供其他服务，需按规定缴纳增值税，并开具相应的发票。
发票的保管与使用
合作社应妥善保管发票，并按照税务机关的规定使用。销售方需在对账及税票的报销等方面明确记录，以备查询、复核及税务报销等事宜。
代开发票
若合作社不具备增值税一般纳税人资格，可以向当地主管税务机关申请代开增值税专用发票。代开时，合作社需预先缴纳开票的增值税及各项附加税。
建议
合作社应确保按照税务机关的规定进行税务登记和发票管理，以合法合规地开具和使用发票。
若合作社规模较大，建议尽早申请成为增值税一般纳税人，以便更高效地处理发票和税务事宜。