公司代缴社保的账务处理可以按照以下步骤进行：
计提社保费用
借：管理费用/销售费用/制造费用等
贷：应付职工薪酬—社会保险费（企业部分）
支付社保费用给中介机构 （如果通过中介机构代缴）：
借：其他应收款—中介机构
贷：银行存款
中介机构代缴社保并转交给公司
收到款项时：
借：银行存款
贷：其他应付款
代缴社保时：
借：其他应付款—社保保险费（个人部分）
贷：银行存款
公司实际缴纳社保费用
借：应付职工薪酬—社保保险费（企业部分）
借：其他应付款—社保保险费（个人部分）
贷：银行存款
从工资中扣除个人社保承担部分
借：应付职工薪酬—工资
贷：银行存款
其他应收款—代缴社保（个人部分）
发放工资时
如果之前已扣除个人社保部分，则不再重复扣除。
以上步骤根据最新的会计规定和实务操作进行整理，请根据实际业务发生时的具体情况进行调整。