对于已认证的税控发票，您应该按照以下步骤处理：
抵扣票面税额
认证后的发票只能抵扣票面税额，不能按全额金额抵扣。
账务处理
认证后，根据发票内容进行相应的账务处理，例如：
```
借：固定资产-税控设备
借：应交税费-应交增值税（进项税）
贷：银行存款
```
进项转出
如果需要转出进项税额，您可以在税控发票开票软件中制作“红字增值税专用信息表”，然后销售方根据信息表编号开具红字发票。
转出进项税额的会计分录示例：
```
借：管理费用
贷：应交税费-应交增值税（进项税额转出）
```
开具红字发票
如果发票开错或者需要重开，购货方需要先开具并上传《开具红字增值税专用发票信息表》，然后销售方根据该信息表开具红字发票。
发票作废情况
如果发票已经被销售方作废，且购货方已经认证，则不能抵扣进项税，需要做进项转出处理。
请确保在进行上述操作时，遵循当地税务机关的规定和程序。